任何水源中，都含有不同程度的杂质，而微灌系统中灌水器出口的孔径很小，灌水器很容易被水源中的杂质堵塞。因此对灌溉水源进行严格的过滤处理是微灌中必不可少的首要步骤，是保障微灌系统正常运行，延长灌水器使用寿命和保障灌溉质量的关键措施。